Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY2

Tarsl2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarsl2Q8BLY2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarsl2Q8BLY2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarsl2Q8BLY2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarsl2Q8BLY2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarsl2Q8BLY2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarsl2Q8BLY2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarsl2Q8BLY2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarsl2Q8BLY2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarsl2Q8BLY2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarsl2Q8BLY2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarsl2Q8BLY2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarsl2Q8BLY2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tarsl2Q8BLY2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarsl2Q8BLY2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tarsl2Q8BLY2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tarsl2Q8BLY2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms