Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
D130040H23RikQ8BII3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
D130040H23RikQ8BII3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
D130040H23RikQ8BII3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
D130040H23RikQ8BII3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
D130040H23RikQ8BII3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
D130040H23RikQ8BII3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
D130040H23RikQ8BII3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
D130040H23RikQ8BII3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
D130040H23RikQ8BII3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
D130040H23RikQ8BII3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
D130040H23RikQ8BII3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
D130040H23RikQ8BII3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
D130040H23RikQ8BII3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
D130040H23RikQ8BII3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
D130040H23RikQ8BII3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
D130040H23RikQ8BII3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D130040H23RikQ8BII3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D130040H23RikQ8BII3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
D130040H23RikQ8BII3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
D130040H23RikQ8BII3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
D130040H23RikQ8BII3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
D130040H23RikQ8BII3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
D130040H23RikQ8BII3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
D130040H23RikQ8BII3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms