Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933430I17RikQ8BHW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
4933430I17RikQ8BHW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933430I17RikQ8BHW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933430I17RikQ8BHW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933430I17RikQ8BHW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933430I17RikQ8BHW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933430I17RikQ8BHW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933430I17RikQ8BHW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933430I17RikQ8BHW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933430I17RikQ8BHW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933430I17RikQ8BHW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933430I17RikQ8BHW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933430I17RikQ8BHW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933430I17RikQ8BHW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933430I17RikQ8BHW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933430I17RikQ8BHW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms