Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD8

Pcmtd2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd2Q8BHD8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcmtd2Q8BHD8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcmtd2Q8BHD8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcmtd2Q8BHD8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcmtd2Q8BHD8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcmtd2Q8BHD8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcmtd2Q8BHD8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcmtd2Q8BHD8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcmtd2Q8BHD8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcmtd2Q8BHD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcmtd2Q8BHD8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcmtd2Q8BHD8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmtd2Q8BHD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmtd2Q8BHD8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcmtd2Q8BHD8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcmtd2Q8BHD8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcmtd2Q8BHD8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms