Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3aQ8BG67 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efr3aQ8BG67 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efr3aQ8BG67 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efr3aQ8BG67 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efr3aQ8BG67 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efr3aQ8BG67 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efr3aQ8BG67 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efr3aQ8BG67 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efr3aQ8BG67 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Efr3aQ8BG67 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efr3aQ8BG67 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efr3aQ8BG67 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms