Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Necab1Q8BG18 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Necab1Q8BG18 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Necab1Q8BG18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Necab1Q8BG18 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Necab1Q8BG18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Necab1Q8BG18 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Necab1Q8BG18 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Necab1Q8BG18 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms