Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfascQ810U3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfascQ810U3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfascQ810U3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfascQ810U3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfascQ810U3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfascQ810U3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfascQ810U3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms