Protein–RNA interactions for Protein: Q810P3

Cdkn3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn3Q810P3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdkn3Q810P3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdkn3Q810P3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdkn3Q810P3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdkn3Q810P3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn3Q810P3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdkn3Q810P3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdkn3Q810P3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkn3Q810P3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkn3Q810P3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkn3Q810P3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkn3Q810P3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkn3Q810P3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkn3Q810P3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkn3Q810P3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdkn3Q810P3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkn3Q810P3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkn3Q810P3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkn3Q810P3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkn3Q810P3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkn3Q810P3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkn3Q810P3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkn3Q810P3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkn3Q810P3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkn3Q810P3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdkn3Q810P3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkn3Q810P3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkn3Q810P3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkn3Q810P3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkn3Q810P3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkn3Q810P3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms