Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RubcnQ80U62 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RubcnQ80U62 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RubcnQ80U62 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RubcnQ80U62 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RubcnQ80U62 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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RubcnQ80U62 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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RubcnQ80U62 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RubcnQ80U62 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RubcnQ80U62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RubcnQ80U62 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RubcnQ80U62 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RubcnQ80U62 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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RubcnQ80U62 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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RubcnQ80U62 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RubcnQ80U62 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RubcnQ80U62 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RubcnQ80U62 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RubcnQ80U62 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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RubcnQ80U62 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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RubcnQ80U62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RubcnQ80U62 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RubcnQ80U62 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RubcnQ80U62 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RubcnQ80U62 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
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RubcnQ80U62 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RubcnQ80U62 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RubcnQ80U62 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RubcnQ80U62 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
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RubcnQ80U62 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RubcnQ80U62 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
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RubcnQ80U62 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RubcnQ80U62 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RubcnQ80U62 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RubcnQ80U62 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RubcnQ80U62 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RubcnQ80U62 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RubcnQ80U62 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RubcnQ80U62 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RubcnQ80U62 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RubcnQ80U62 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RubcnQ80U62 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RubcnQ80U62 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RubcnQ80U62 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RubcnQ80U62 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
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