Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN37

Trpm4, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm4Q7TN37 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm4Q7TN37 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm4Q7TN37 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm4Q7TN37 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm4Q7TN37 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm4Q7TN37 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm4Q7TN37 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm4Q7TN37 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm4Q7TN37 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm4Q7TN37 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm4Q7TN37 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm4Q7TN37 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm4Q7TN37 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm4Q7TN37 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm4Q7TN37 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm4Q7TN37 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm4Q7TN37 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm4Q7TN37 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm4Q7TN37 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm4Q7TN37 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm4Q7TN37 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm4Q7TN37 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm4Q7TN37 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm4Q7TN37 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm4Q7TN37 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm4Q7TN37 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm4Q7TN37 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm4Q7TN37 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm4Q7TN37 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm4Q7TN37 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm4Q7TN37 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm4Q7TN37 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm4Q7TN37 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm4Q7TN37 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm4Q7TN37 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm4Q7TN37 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm4Q7TN37 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm4Q7TN37 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm4Q7TN37 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm4Q7TN37 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms