Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ScocQ78YZ6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScocQ78YZ6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ScocQ78YZ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ScocQ78YZ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ScocQ78YZ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ScocQ78YZ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms