Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,94■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21,9■■□□□ 1,1
ScocQ78YZ6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21,88■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,88■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,88■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,85■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
ScocQ78YZ6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21,79■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
ScocQ78YZ6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,74■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,72■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,71■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,07
ScocQ78YZ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21,69■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,67■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,66■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,65■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
ScocQ78YZ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
ScocQ78YZ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms