Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Usp34Q6ZQ93 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp34Q6ZQ93 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp34Q6ZQ93 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp34Q6ZQ93 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp34Q6ZQ93 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp34Q6ZQ93 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp34Q6ZQ93 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp34Q6ZQ93 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp34Q6ZQ93 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp34Q6ZQ93 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp34Q6ZQ93 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp34Q6ZQ93 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp34Q6ZQ93 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp34Q6ZQ93 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp34Q6ZQ93 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp34Q6ZQ93 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp34Q6ZQ93 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp34Q6ZQ93 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp34Q6ZQ93 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp34Q6ZQ93 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp34Q6ZQ93 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp34Q6ZQ93 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp34Q6ZQ93 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp34Q6ZQ93 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp34Q6ZQ93 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp34Q6ZQ93 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp34Q6ZQ93 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp34Q6ZQ93 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp34Q6ZQ93 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms