Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnot1Q6ZQ08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnot1Q6ZQ08 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot1Q6ZQ08 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot1Q6ZQ08 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot1Q6ZQ08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot1Q6ZQ08 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot1Q6ZQ08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot1Q6ZQ08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot1Q6ZQ08 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot1Q6ZQ08 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot1Q6ZQ08 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot1Q6ZQ08 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot1Q6ZQ08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnot1Q6ZQ08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms