Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg5Q6ZPY2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg5Q6ZPY2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg5Q6ZPY2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg5Q6ZPY2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg5Q6ZPY2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg5Q6ZPY2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms