Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp140Q6NSQ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp140Q6NSQ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp140Q6NSQ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp140Q6NSQ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp140Q6NSQ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sp140Q6NSQ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sp140Q6NSQ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp140Q6NSQ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Sp140Q6NSQ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sp140Q6NSQ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sp140Q6NSQ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sp140Q6NSQ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sp140Q6NSQ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sp140Q6NSQ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sp140Q6NSQ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sp140Q6NSQ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp140Q6NSQ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp140Q6NSQ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms