Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm4Q6IRU2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm4Q6IRU2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm4Q6IRU2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm4Q6IRU2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm4Q6IRU2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms