Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt39Q6IFX4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt39Q6IFX4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt39Q6IFX4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt39Q6IFX4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt39Q6IFX4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt39Q6IFX4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt39Q6IFX4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt39Q6IFX4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt39Q6IFX4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt39Q6IFX4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt39Q6IFX4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt39Q6IFX4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt39Q6IFX4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt39Q6IFX4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krt39Q6IFX4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krt39Q6IFX4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt39Q6IFX4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt39Q6IFX4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt39Q6IFX4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt39Q6IFX4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt39Q6IFX4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt39Q6IFX4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt39Q6IFX4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt39Q6IFX4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt39Q6IFX4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt39Q6IFX4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt39Q6IFX4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt39Q6IFX4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt39Q6IFX4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt39Q6IFX4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt39Q6IFX4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms