Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scaf8Q6DID3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf8Q6DID3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf8Q6DID3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf8Q6DID3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf8Q6DID3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scaf8Q6DID3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf8Q6DID3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf8Q6DID3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf8Q6DID3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf8Q6DID3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf8Q6DID3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf8Q6DID3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf8Q6DID3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scaf8Q6DID3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scaf8Q6DID3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Scaf8Q6DID3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Scaf8Q6DID3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Scaf8Q6DID3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scaf8Q6DID3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Scaf8Q6DID3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scaf8Q6DID3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scaf8Q6DID3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Scaf8Q6DID3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scaf8Q6DID3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scaf8Q6DID3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scaf8Q6DID3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scaf8Q6DID3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scaf8Q6DID3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scaf8Q6DID3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scaf8Q6DID3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Scaf8Q6DID3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Scaf8Q6DID3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Scaf8Q6DID3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scaf8Q6DID3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf8Q6DID3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf8Q6DID3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf8Q6DID3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf8Q6DID3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scaf8Q6DID3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scaf8Q6DID3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scaf8Q6DID3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms