Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q6DFW0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q6DFW0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6DFW0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6DFW0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6DFW0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6DFW0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q6DFW0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q6DFW0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q6DFW0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q6DFW0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q6DFW0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Q6DFW0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q6DFW0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q6DFW0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q6DFW0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q6DFW0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q6DFW0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q6DFW0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q6DFW0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q6DFW0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Q6DFW0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q6DFW0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q6DFW0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q6DFW0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q6DFW0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q6DFW0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q6DFW0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q6DFW0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q6DFW0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q6DFW0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q6DFW0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q6DFW0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q6DFW0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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