Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Knl1Q66JQ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Knl1Q66JQ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Knl1Q66JQ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Knl1Q66JQ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Knl1Q66JQ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Knl1Q66JQ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Knl1Q66JQ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Knl1Q66JQ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Knl1Q66JQ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Knl1Q66JQ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Knl1Q66JQ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Knl1Q66JQ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Knl1Q66JQ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Knl1Q66JQ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Knl1Q66JQ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Knl1Q66JQ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Knl1Q66JQ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Knl1Q66JQ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Knl1Q66JQ7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Knl1Q66JQ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Knl1Q66JQ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Knl1Q66JQ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Knl1Q66JQ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Knl1Q66JQ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Knl1Q66JQ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Knl1Q66JQ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Knl1Q66JQ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Knl1Q66JQ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Knl1Q66JQ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Knl1Q66JQ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Knl1Q66JQ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Knl1Q66JQ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Knl1Q66JQ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Knl1Q66JQ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Knl1Q66JQ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Knl1Q66JQ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Knl1Q66JQ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Knl1Q66JQ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Knl1Q66JQ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Knl1Q66JQ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Knl1Q66JQ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Knl1Q66JQ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Knl1Q66JQ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Knl1Q66JQ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Knl1Q66JQ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms