Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt12Q64291 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt12Q64291 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt12Q64291 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt12Q64291 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt12Q64291 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt12Q64291 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt12Q64291 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms