Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phc1Q64028 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phc1Q64028 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phc1Q64028 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phc1Q64028 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phc1Q64028 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Phc1Q64028 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phc1Q64028 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phc1Q64028 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phc1Q64028 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phc1Q64028 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Phc1Q64028 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phc1Q64028 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phc1Q64028 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phc1Q64028 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phc1Q64028 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phc1Q64028 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Phc1Q64028 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phc1Q64028 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phc1Q64028 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phc1Q64028 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phc1Q64028 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phc1Q64028 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phc1Q64028 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms