Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smad2Q62432 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smad2Q62432 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smad2Q62432 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smad2Q62432 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Smad2Q62432 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smad2Q62432 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smad2Q62432 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smad2Q62432 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smad2Q62432 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smad2Q62432 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smad2Q62432 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smad2Q62432 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smad2Q62432 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smad2Q62432 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smad2Q62432 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smad2Q62432 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smad2Q62432 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smad2Q62432 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad2Q62432 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad2Q62432 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad2Q62432 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smad2Q62432 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smad2Q62432 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smad2Q62432 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smad2Q62432 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smad2Q62432 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms