Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sorbs1Q62417 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sorbs1Q62417 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sorbs1Q62417 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sorbs1Q62417 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sorbs1Q62417 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sorbs1Q62417 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sorbs1Q62417 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sorbs1Q62417 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sorbs1Q62417 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sorbs1Q62417 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sorbs1Q62417 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sorbs1Q62417 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sorbs1Q62417 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sorbs1Q62417 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sorbs1Q62417 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sorbs1Q62417 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sorbs1Q62417 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sorbs1Q62417 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sorbs1Q62417 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sorbs1Q62417 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sorbs1Q62417 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms