Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcbp2Q61990 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp2Q61990 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcbp2Q61990 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcbp2Q61990 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcbp2Q61990 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcbp2Q61990 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcbp2Q61990 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcbp2Q61990 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcbp2Q61990 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcbp2Q61990 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp2Q61990 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp2Q61990 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp2Q61990 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcbp2Q61990 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms