Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd47Q61735 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd47Q61735 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd47Q61735 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd47Q61735 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd47Q61735 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd47Q61735 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd47Q61735 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd47Q61735 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd47Q61735 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd47Q61735 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd47Q61735 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd47Q61735 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd47Q61735 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd47Q61735 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd47Q61735 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd47Q61735 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd47Q61735 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd47Q61735 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd47Q61735 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd47Q61735 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd47Q61735 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd47Q61735 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd47Q61735 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd47Q61735 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd47Q61735 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd47Q61735 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd47Q61735 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd47Q61735 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms