Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Foxd1Q61345 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Foxd1Q61345 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Foxd1Q61345 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Foxd1Q61345 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Foxd1Q61345 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Foxd1Q61345 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Foxd1Q61345 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Foxd1Q61345 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Foxd1Q61345 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Foxd1Q61345 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Foxd1Q61345 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Foxd1Q61345 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Foxd1Q61345 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Foxd1Q61345 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Foxd1Q61345 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Foxd1Q61345 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Foxd1Q61345 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Foxd1Q61345 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Foxd1Q61345 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Foxd1Q61345 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Foxd1Q61345 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Foxd1Q61345 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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