Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DbpQ60925 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DbpQ60925 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DbpQ60925 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DbpQ60925 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DbpQ60925 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DbpQ60925 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DbpQ60925 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DbpQ60925 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DbpQ60925 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DbpQ60925 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DbpQ60925 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DbpQ60925 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DbpQ60925 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DbpQ60925 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DbpQ60925 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DbpQ60925 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DbpQ60925 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DbpQ60925 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DbpQ60925 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DbpQ60925 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DbpQ60925 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DbpQ60925 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DbpQ60925 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms