Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp1r1bQ60829 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppp1r1bQ60829 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppp1r1bQ60829 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp1r1bQ60829 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp1r1bQ60829 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppp1r1bQ60829 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppp1r1bQ60829 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppp1r1bQ60829 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppp1r1bQ60829 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp1r1bQ60829 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp1r1bQ60829 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp1r1bQ60829 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp1r1bQ60829 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp1r1bQ60829 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp1r1bQ60829 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp1r1bQ60829 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp1r1bQ60829 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ppp1r1bQ60829 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp1r1bQ60829 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp1r1bQ60829 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ppp1r1bQ60829 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppp1r1bQ60829 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp1r1bQ60829 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp1r1bQ60829 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp1r1bQ60829 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp1r1bQ60829 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp1r1bQ60829 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp1r1bQ60829 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppp1r1bQ60829 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppp1r1bQ60829 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms