Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2f1Q60632 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr2f1Q60632 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr2f1Q60632 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2f1Q60632 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr2f1Q60632 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr2f1Q60632 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr2f1Q60632 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2f1Q60632 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2f1Q60632 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr2f1Q60632 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr2f1Q60632 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms