Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mks1Q5SW45 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mks1Q5SW45 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Mks1Q5SW45 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mks1Q5SW45 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mks1Q5SW45 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mks1Q5SW45 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms