Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CluhQ5SW19 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CluhQ5SW19 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CluhQ5SW19 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CluhQ5SW19 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CluhQ5SW19 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CluhQ5SW19 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CluhQ5SW19 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CluhQ5SW19 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CluhQ5SW19 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CluhQ5SW19 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CluhQ5SW19 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CluhQ5SW19 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CluhQ5SW19 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CluhQ5SW19 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CluhQ5SW19 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CluhQ5SW19 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CluhQ5SW19 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CluhQ5SW19 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CluhQ5SW19 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CluhQ5SW19 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CluhQ5SW19 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CluhQ5SW19 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CluhQ5SW19 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CluhQ5SW19 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CluhQ5SW19 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CluhQ5SW19 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CluhQ5SW19 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CluhQ5SW19 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CluhQ5SW19 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CluhQ5SW19 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CluhQ5SW19 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CluhQ5SW19 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CluhQ5SW19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CluhQ5SW19 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CluhQ5SW19 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CluhQ5SW19 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CluhQ5SW19 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CluhQ5SW19 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CluhQ5SW19 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CluhQ5SW19 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CluhQ5SW19 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CluhQ5SW19 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CluhQ5SW19 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CluhQ5SW19 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CluhQ5SW19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CluhQ5SW19 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms