Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71bQ5STT6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71bQ5STT6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71bQ5STT6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71bQ5STT6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71bQ5STT6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71bQ5STT6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71bQ5STT6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam71bQ5STT6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71bQ5STT6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71bQ5STT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71bQ5STT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam71bQ5STT6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam71bQ5STT6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71bQ5STT6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms