Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q504N7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q504N7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q504N7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q504N7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q504N7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q504N7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q504N7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q504N7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q504N7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q504N7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q504N7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q504N7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q504N7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q504N7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q504N7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q504N7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q504N7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q504N7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q504N7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q504N7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q504N7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q504N7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q504N7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q504N7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q504N7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q504N7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q504N7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q504N7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q504N7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q504N7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q504N7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q504N7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q504N7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q504N7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q504N7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q504N7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q504N7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q504N7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q504N7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q504N7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q504N7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q504N7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q504N7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q504N7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q504N7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q504N7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q504N7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q504N7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q504N7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q504N7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q504N7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q504N7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q504N7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q504N7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q504N7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q504N7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q504N7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q504N7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q504N7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q504N7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q504N7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q504N7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q504N7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q504N7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q504N7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q504N7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q504N7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q504N7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q504N7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q504N7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q504N7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q504N7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q504N7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q504N7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q504N7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q504N7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q504N7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q504N7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q504N7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q504N7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q504N7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q504N7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q504N7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q504N7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q504N7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q504N7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q504N7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q504N7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q504N7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q504N7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q504N7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q504N7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q504N7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q504N7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q504N7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q504N7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q504N7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q504N7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q504N7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms