Protein–RNA interactions for Protein: Q504N0

Cpa2, Carboxypeptidase A2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa2Q504N0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cpa2Q504N0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cpa2Q504N0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cpa2Q504N0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cpa2Q504N0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cpa2Q504N0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cpa2Q504N0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cpa2Q504N0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cpa2Q504N0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cpa2Q504N0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cpa2Q504N0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cpa2Q504N0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cpa2Q504N0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cpa2Q504N0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cpa2Q504N0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cpa2Q504N0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cpa2Q504N0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpa2Q504N0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpa2Q504N0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms