Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga1Q3V3R4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itga1Q3V3R4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga1Q3V3R4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga1Q3V3R4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga1Q3V3R4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga1Q3V3R4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Itga1Q3V3R4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga1Q3V3R4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga1Q3V3R4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga1Q3V3R4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga1Q3V3R4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itga1Q3V3R4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms