Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D3

Ampd1, AMP deaminase 1, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd1Q3V1D3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ampd1Q3V1D3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ampd1Q3V1D3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ampd1Q3V1D3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ampd1Q3V1D3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ampd1Q3V1D3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ampd1Q3V1D3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ampd1Q3V1D3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ampd1Q3V1D3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ampd1Q3V1D3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ampd1Q3V1D3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ampd1Q3V1D3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ampd1Q3V1D3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ampd1Q3V1D3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ampd1Q3V1D3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ampd1Q3V1D3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ampd1Q3V1D3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms