Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn34b4Q3V0X2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn34b4Q3V0X2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn34b4Q3V0X2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn34b4Q3V0X2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn34b4Q3V0X2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn34b4Q3V0X2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn34b4Q3V0X2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn34b4Q3V0X2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn34b4Q3V0X2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn34b4Q3V0X2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn34b4Q3V0X2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms