Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm44Q3V089 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm44Q3V089 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm44Q3V089 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm44Q3V089 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rbm44Q3V089 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbm44Q3V089 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbm44Q3V089 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm44Q3V089 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm44Q3V089 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbm44Q3V089 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbm44Q3V089 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms