Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
B230104I21RikQ3USW4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
B230104I21RikQ3USW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
B230104I21RikQ3USW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
B230104I21RikQ3USW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
B230104I21RikQ3USW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
B230104I21RikQ3USW4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
B230104I21RikQ3USW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
B230104I21RikQ3USW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
B230104I21RikQ3USW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
B230104I21RikQ3USW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
B230104I21RikQ3USW4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
B230104I21RikQ3USW4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
B230104I21RikQ3USW4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
B230104I21RikQ3USW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
B230104I21RikQ3USW4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
B230104I21RikQ3USW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
B230104I21RikQ3USW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
B230104I21RikQ3USW4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B230104I21RikQ3USW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
B230104I21RikQ3USW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
B230104I21RikQ3USW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B230104I21RikQ3USW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B230104I21RikQ3USW4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B230104I21RikQ3USW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B230104I21RikQ3USW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B230104I21RikQ3USW4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
B230104I21RikQ3USW4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B230104I21RikQ3USW4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B230104I21RikQ3USW4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B230104I21RikQ3USW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
B230104I21RikQ3USW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B230104I21RikQ3USW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B230104I21RikQ3USW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B230104I21RikQ3USW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B230104I21RikQ3USW4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B230104I21RikQ3USW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B230104I21RikQ3USW4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B230104I21RikQ3USW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
B230104I21RikQ3USW4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
B230104I21RikQ3USW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
B230104I21RikQ3USW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B230104I21RikQ3USW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms