Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ28

Pxdn, Peroxidasin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxdnQ3UQ28 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PxdnQ3UQ28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PxdnQ3UQ28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PxdnQ3UQ28 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PxdnQ3UQ28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
PxdnQ3UQ28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PxdnQ3UQ28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PxdnQ3UQ28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PxdnQ3UQ28 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PxdnQ3UQ28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PxdnQ3UQ28 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PxdnQ3UQ28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PxdnQ3UQ28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PxdnQ3UQ28 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PxdnQ3UQ28 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PxdnQ3UQ28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PxdnQ3UQ28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PxdnQ3UQ28 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
PxdnQ3UQ28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PxdnQ3UQ28 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PxdnQ3UQ28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PxdnQ3UQ28 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PxdnQ3UQ28 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PxdnQ3UQ28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
PxdnQ3UQ28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PxdnQ3UQ28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PxdnQ3UQ28 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PxdnQ3UQ28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PxdnQ3UQ28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PxdnQ3UQ28 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PxdnQ3UQ28 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PxdnQ3UQ28 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PxdnQ3UQ28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PxdnQ3UQ28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PxdnQ3UQ28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PxdnQ3UQ28 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PxdnQ3UQ28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PxdnQ3UQ28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PxdnQ3UQ28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PxdnQ3UQ28 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PxdnQ3UQ28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PxdnQ3UQ28 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PxdnQ3UQ28 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
PxdnQ3UQ28 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PxdnQ3UQ28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PxdnQ3UQ28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PxdnQ3UQ28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PxdnQ3UQ28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PxdnQ3UQ28 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PxdnQ3UQ28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PxdnQ3UQ28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PxdnQ3UQ28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PxdnQ3UQ28 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PxdnQ3UQ28 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PxdnQ3UQ28 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
PxdnQ3UQ28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PxdnQ3UQ28 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PxdnQ3UQ28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PxdnQ3UQ28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PxdnQ3UQ28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PxdnQ3UQ28 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PxdnQ3UQ28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PxdnQ3UQ28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PxdnQ3UQ28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PxdnQ3UQ28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PxdnQ3UQ28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PxdnQ3UQ28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PxdnQ3UQ28 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PxdnQ3UQ28 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PxdnQ3UQ28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
PxdnQ3UQ28 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PxdnQ3UQ28 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PxdnQ3UQ28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PxdnQ3UQ28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PxdnQ3UQ28 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms