Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcgf5Q3UK78 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcgf5Q3UK78 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf5Q3UK78 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf5Q3UK78 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf5Q3UK78 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf5Q3UK78 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf5Q3UK78 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcgf5Q3UK78 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcgf5Q3UK78 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf5Q3UK78 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcgf5Q3UK78 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf5Q3UK78 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf5Q3UK78 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf5Q3UK78 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf5Q3UK78 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf5Q3UK78 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf5Q3UK78 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf5Q3UK78 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf5Q3UK78 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcgf5Q3UK78 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms