Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Yipf3Q3UDR8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Yipf3Q3UDR8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Yipf3Q3UDR8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Yipf3Q3UDR8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Yipf3Q3UDR8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms