Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm45902Q3UDN3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm45902Q3UDN3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm45902Q3UDN3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm45902Q3UDN3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm45902Q3UDN3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm45902Q3UDN3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms