Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pag1Q3U1F9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pag1Q3U1F9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pag1Q3U1F9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pag1Q3U1F9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pag1Q3U1F9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pag1Q3U1F9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pag1Q3U1F9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pag1Q3U1F9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pag1Q3U1F9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pag1Q3U1F9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pag1Q3U1F9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pag1Q3U1F9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pag1Q3U1F9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pag1Q3U1F9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pag1Q3U1F9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pag1Q3U1F9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pag1Q3U1F9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms