Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde12Q3TIU4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde12Q3TIU4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde12Q3TIU4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde12Q3TIU4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde12Q3TIU4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde12Q3TIU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde12Q3TIU4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde12Q3TIU4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde12Q3TIU4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pde12Q3TIU4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde12Q3TIU4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde12Q3TIU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde12Q3TIU4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde12Q3TIU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde12Q3TIU4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde12Q3TIU4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms