Protein–RNA interactions for Protein: Q3TFD2

Lpcat1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat1Q3TFD2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpcat1Q3TFD2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpcat1Q3TFD2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpcat1Q3TFD2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lpcat1Q3TFD2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lpcat1Q3TFD2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lpcat1Q3TFD2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpcat1Q3TFD2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpcat1Q3TFD2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lpcat1Q3TFD2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lpcat1Q3TFD2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lpcat1Q3TFD2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lpcat1Q3TFD2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lpcat1Q3TFD2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lpcat1Q3TFD2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms