Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rspo3Q2TJ95 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rspo3Q2TJ95 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rspo3Q2TJ95 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rspo3Q2TJ95 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo3Q2TJ95 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rspo3Q2TJ95 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rspo3Q2TJ95 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rspo3Q2TJ95 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rspo3Q2TJ95 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms