Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap9Q1HDU4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap9Q1HDU4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap9Q1HDU4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap9Q1HDU4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap9Q1HDU4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap9Q1HDU4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arhgap9Q1HDU4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arhgap9Q1HDU4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap9Q1HDU4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arhgap9Q1HDU4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap9Q1HDU4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap9Q1HDU4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arhgap9Q1HDU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap9Q1HDU4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap9Q1HDU4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Arhgap9Q1HDU4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms