Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930480E11RikQ0VG34 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930480E11RikQ0VG34 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930480E11RikQ0VG34 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930480E11RikQ0VG34 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930480E11RikQ0VG34 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
4930480E11RikQ0VG34 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms